操作条件对于色谱分离有很大影响。
１、柱长，柱内径：一般讲，柱管增长，可改善分离能力，短则组分馏出的快些；柱内径小分离效果好，柱内径大处理量大，但柱内径过大，将导致担体不能均匀地分布在色谱柱中。分析用柱管一般内径为３－６毫米，柱长为１－４米。
２，中端气相色谱仪排行、柱温：是一个重要的操作变数，直接影响分离效能和分析速度。选择柱温的根据是混合物的沸点范围，中端气相色谱仪排行，固定液的配比和鉴定器的灵敏度。提高柱温可缩短分析时间；降低柱温可使色谱柱选择性增大，有利于组分的分离和色谱柱稳定性提高，柱寿命延长。一般采用等于或高于数十度于样品的平均沸点的柱温为较合适，对易挥发样用低柱温，中端气相色谱仪排行，不易挥发的样品采用高柱温。
３、载气流速：载气流速是决定色谱分离的重要原因之一。一般讲流速高色谱峰狭，反之则宽些，但流速过高或过低对分离都有不利的影响。流速要求要平稳，常用的流速范围每分钟在１０－１００亳升之间。 气相色谱仪的毛细管柱的分析速度约为填充柱的数十倍。由于液膜极薄，分配比k很小，相比大。中端气相色谱仪排行
气相色谱仪的热传导检测器（TCD）的清洗
将**，十氢萘等溶剂装满鉴定器的测量池，浸泡一段时间（20分钟左右）后倾出，如此反复进行多次至所倾出的溶液比较干净为止。
当选用一种溶剂不能洗净时，可根据沾污物的性质先选用高沸点溶剂进行浸泡清洗，然后再用低沸点溶剂反复清洗。洗净后加热赶去溶剂，再装到仪器上，加热鉴测器，通载气冲洗数小时后即可使用。
当沾污不太严重时，可不必卸下清洗，此时只需要将色谱柱取下，用一根管子将进样口与鉴定器联接起来，然后通载气并将鉴测器炉温升至120度以上，从进样口先注入20微升左右的蒸馏水，再用几十微升**或氟里昂溶剂进行清洗。 全自动气相色谱仪经销商气相色谱仪的柱箱内的梯度很小。对于一些成份复杂、沸程较宽的样品，柱箱还可进行三阶程序升温控制。
气相色谱仪的FID的灵敏度与氢气、空气和氮气的比例有直接关系，因此，要注意优化。一般三者的比例应接近或等于l:10:l，如，氢气30~40mL/min，空气300~400ml/min，氮气30~40ml/min。另外，有些仪器设计有不同的喷嘴分别用于填充柱和毛细管柱，使用时应查看说明书。
为防止检测器被污染，检测器温度设置不应低于色谱柱实际工作的最高温度。一旦检测器被污染，轻则灵敏度明显下降或噪声增大，重则点不着火。消除污染的办法是清洗，主要是清洗喷嘴表面和气路管道。具体方法是拆F喷嘴，依次用不同极性的溶剂（如**、氯仿和乙醇）浸泡，并在超声波水浴中超声10min以上。还可用细不锈钢理穿过喷嘴中间的孔，或用酒精灯烧掉喷嘴内的油状物，以达到彻底清洗的目的。有时使用时间长了，喷嘴表面会积碳（一层黑色沉积物），这也会影响灵敏度。可用细砂纸轻轻打磨表面而除去。清洗之后将喷嘴烘干，再装在检测器上进行测定。
从表I可以看出，GC气相色谱仪的色谱柱的内径是确定GC色谱柱固有效率的一个因素。但是，色谱柱长度也是决定色谱柱效率的根本因素，我们可以通过以下公式来帮助理解这些影响；
N=L/H
将色谱柱长度加倍将使效率（N）翻倍，并将分离度提高1.4倍；将色谱柱长度减半将使色谱柱效率减半，并且将分离度降低1.4倍。
就GC色谱柱固定相的膜厚而言，其可能会以不同方式影响早期和之后洗脱峰的柱效，k'值<5的分析物可能会随着膜厚的增加而降低效率，k'值>5时反之亦然。但是，除非大幅度改变膜厚度（例如，从0.1mm改变为1mm），否则改变膜厚度的效果不会太剧烈。这些值在等温分离中适用，而在梯度温度编程分离中则不同，但是趋势仍然适用。综上所述的信息将使我们可以估计我们选择用于分析的色谱柱的预期塔板数，从而可以评估效率，因此，偏离这些预期值的任何重大偏差都可以视为值得研究与故障排除。关于气相色谱效率的基本理论的一部分是所选载气的影响及其通过色谱柱的流速。从图3可以看出，各种载气在不同载气线速度下的效率高（低高度相当于理论塔板（HETP，H））。线速度是色谱柱内径和流速的函数。 配合静态顶空进样装置的气相色谱仪可以完成血液中乙醇含量的测定以及药品中残留溶剂的分析。
影响分离效率的因素很多，都与将样品引入气相色谱仪GC系统的方式直接相关。进样口衬管的清洁度和失活是主要考虑因素，在分流进样中，衬管中的任何活性部位的破坏可能会影响分析物向GC色谱柱顶部的转移，这在处理极性分析物时尤为明显。如果衬管清洁度不高或未显示出来，则衬管清洁度通常与峰拖尾有关仅出现轻微的活动迹象（失活涂层消失），然后可能会导致峰的总体变宽。确保衬管清洁，并在必要时定期更换衬管。以下是重要的要点总结：维持足够长的不分流时间，以将所有分析物转移至色谱柱，但也应足够短，以免溶剂从进样口缓慢流失，从而导致色谱破坏，柱箱的初始温度应至少比样品溶剂的沸点低10℃，固定相的极性应与样品溶剂的极性相匹配，反之，则应在进样口和分析柱之间留出至少1m长的未涂层保留间隙。如果不满足，上述条件将导致分析物峰形展宽，这主要是由于分析物谱带从入口缓慢进入GC色谱柱时缺乏聚焦，因此效率会降低。气相色谱仪的气固色谱和气液色谱的分类是根据色谱柱中固定相的物理状态进行区分的。中端气相色谱仪排行
气相色谱仪的基线不能调零。对热导池检测器可能是漏气导致热导丝没有完全泡在氢气中。中端气相色谱仪排行
重要的是，在载气中通过系统的分析物必须以不间断的方式进行。因此，气流路径中任何比其周围环境凉爽的“斑点”都将破坏或减慢分析物通过色谱柱的通过，并有效地充当系统中死体积的区域。如果消除了进样口和GC气相色谱仪的色谱柱之间的热滞后，通常在进样口上会出现冷点-杯内有滞后的小杯位于进样口下方是有原因的，因此不应将其移除。位于检测器单元下方的绝缘层也是如此，这也是为什么进入MS检测器的任何传输线也要分别加热的原因，应仔细检查传输线温度以确保其温度至少位于顶部温度与您的烤箱程序一致！中端气相色谱仪排行
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