用于和DNA或RNA结构类似的寡核苷酸合成的自动化仪器,即是DNA合成仪。通常用于固相合成法,每次在长的寡核苷酸链上接入一个核苷酸。加入每一个核苷酸均通过相同的化学反应和相应的嘌呤或嘧啶碱基衍生物作用。仪器不同,所用化学反应和操作细节也会随之发生变化。DNA合成的磷酸酰胺法得到了非常***的应用。结构和性能1、辅助真空隔膜形成一个圆顶小空隙为适当运行阀块的关键。每次打开电磁阀时,在隔膜的螺线管一侧形成辅助真空,使一圆顶空隙形成在隔膜。2、合成柱起始在一次性的柱子中装有结合在载体(一般为CPG)上的核苷酸,不仅有柱体,而且还有2个固定过滤板和2个接头,由惰性材料制成所有的部件。3、流路节流阀小量的试剂长期在流路节流阀中结晶,会阻塞流路。4、废液和排气废气提高排气管往适当的排气装置导入,废液瓶能够在在低于仪器的附近工作台上或者合成仪附近的地板上放置。其是一个空立着的10L的聚苯乙烯容器,为大多数化学试剂输送的终点站。5、电导池一空隙隔开的两个电极组成了电导流动池,天津销售RNA合成仪价烙,应用一小电压在空隙之间。其设计是为了对每个DNA合成循环内释放的DMT阳离子的总电导进行测定。6,天津销售RNA合成仪价烙,天津销售RNA合成仪价烙、电池DNA合成仪通常带有能够使用几年的锂电池。并开拓有关人类疾病和遗传调控的新领域,化学合成DNA在这一过程中将起关键性作用。天津销售RNA合成仪价烙
用于和DNA或RNA结构类似的寡核苷酸合成的自动化仪器,即是DNA合成仪。通常用于固相合成法,每次在长的寡核苷酸链上接入一个核苷酸。加入每一个核苷酸均通过相同的化学反应和相应的嘌呤或嘧啶碱基衍生物作用。仪器不同,所用化学反应和操作细节也会随之发生变化。DNA合成的磷酸酰胺法得到了非常***的应用。操作步骤亚磷酰胺DNA合成的试剂:氨水切除溶液乙腈清洗溶剂12氧化混合物三lv乙酸(TCA)脱保护溶液N—甲基咪唑封闭试剂乙酐四唑偶联催化剂A、G、C、T亚磷酰胺单体保护碱基的5/—DM以以亚磷酰胺寡核苷酸合成为例,操作步骤如下:1、对合成仪上所有试剂瓶中的试剂量认真检。2、在合成仪上装上标记好的干净的收集瓶。3、在合成仪中输入要合成的DNA序列。4、对选择的合成步骤进行检查。5、选择结束方法:仪器的原始状态为TritylOffAuto,如果想要通过5,—DMT基团连接纯化寡核苷酸,那么将其转变为TritylOnAuto结束状态。6、选择结束方法通常是为系统的原始状态。7、将你所希望的保存名字输入到每个柱监视器下。8、每一个收集瓶相应的DNA序列标记用代码代替。9、将每一个柱设置的详细资料打印出来。10、对打印出来的资料进行检查,判断是否正确。天津销售RNA合成仪价烙对于亚磷酰胺,1—8号瓶其压力管道也作为排气管。
11、为了确保合成仪上合成柱处于正确的位置,运行StartColumn步骤对每一个柱的位置进行检查。12、对是否充满连接在合成仪上的溶剂残留(废液瓶)进行检查。13、保证试管充分清洁干净,保证DMT废液管路通向分部收集器。14、将循环启动,运行开始程序对试剂管路进行清洗,将原来的试剂除去。日常维护1.流路节流阀应该1个月清洗1次节流阀,以避免阻塞,清洗时,先在水中煮沸15min,然后再在甲醇中超声波清洗。2.储液瓶需要保持氩气压力以及管路清洁。瓶子在亚磷酰胺及储液瓶位置上放置。3.瓶塞“O”形环zhi少对“O”形环一月检查一次,1年更换1次。比较仪器上的“O”形环与新的备用“O”形环,若有白色沉淀出现在“O”形环上,用棉花蘸取乙腈进行清洗。
**初是sanger法,后来发展了几种高通量测序方法1sanger法:双脱氧测序的原理,DNA合成时加上一个ddNTP从而终止这条链的延伸,毛细管电泳读取分析序列。一般教材讲的都是这种方法,经典,读长800bp,但是通量小成本高。2454:也称焦磷酸测序,一个run下来约400M的数据量。将emulsionPCR产物连磁珠上,放入PicoTiterPlate,测序反应是通过释放PPi经过ATP***化酶和荧光素酶作用发光D捕捉拍照,反应是连续的,所以遇到连续的碱基如polyA时,454易产生误差。3Solexa:边合成边测序,将DNA单链固定在芯片上,合成DNA簇,是一种可逆阻断的合成反应,每个循环只加上一个碱基、系统拍照一次。通过读取拍照信号分析序列,一个run约200个G数据量以上。目前能量比较高,不足是读长短,现在有PE150,可以测通300bp。4Soild:与454有相似之处,该方法更精细,磁珠富集,磁珠更小,密度更高。它的独特之处是连接反应测序,加入8碱基荧光单链混合物。一次测序读两个碱基,获得颜色编码组成的碱基序列,通过几轮反应**终得出序列。5Iontorrent:特点是小巧。试剂通过集成的流体通路进入芯片中,密布于芯片上的反应孔立即成为上百万个微反应体系。当阀门正确设置打开时,储液瓶上部空间由氩气加压,液体被推进输送管,流到其目的地。
对合成的引物先进行稀释,现将方法简单叙述如下::OligoDNA中的每个脱氧核苷酸碱基的平均分子量近似为,则一条OligoDNA的分子量=碱基数×。例:您得到一管标为5OD260的20merOligoDNA分子量=20×质量数=5×33=165μg摩尔数=165/6490=μmol=25nmol若加除菌双蒸水400μl溶解,则浓度为25nmol/400μl=μ,这是指在1ml体积1cm光程标准比色皿中,260nm波长下吸光度为1A260的Oligo溶液定义为1OD260单位,根据此定义,1OD260单位相当于33μg的OligoDNA,您可以根据此数据和您的OligoDNA分子量,计算得到摩尔数以计算不同摩尔浓度的溶液。3.引物序列的分子量计算公式如下:MW=(A碱基数×312)+(C碱基数×288)+(G碱基数×328)+(T碱基数×303)-61例如:引物TGGGCGGCGGTTGGTGTTACGA=1C=3G=11T=6MW=(1×312)+(3×328)+(6×303)-61=65414.装有引物的eppendorf管一般保存于-20℃,临用前稀释。5.由于OligoDNA呈很轻的干膜状附在管壁上,打开时极易散失,所以打开管子前请先离心10,000rpm,1min,然后再慢慢打开管盖。6.在装有引物的eppendorf管内加入100-500μl双蒸水,盖上管盖,充分上下振荡5-10分钟,再次离心10,000rpm,1min。7.计算原引物管primer的浓度。所用化学反应和操作细节随不同的仪器而改变。广东进口RNA合成仪价烙
设计用于合成结构上类似DNA或RNA的寡核苷酸的自动化仪器。天津销售RNA合成仪价烙
细胞冻存.复苏方法ziv/更新于2012-06-19点击量:4571.细胞:选对数生长期细胞,收集细胞24小时前换液一次。2.计数:按常规方法把细胞制成细胞悬液,计数,令细胞密度达5×106/ml,离心去上清,吸入离心管中。3.冻存液:先用培养液9分+DMSO1分(或甘油)配成10%的DMSO冻存液,按上法一滴滴加入离心管中,然后用吸管轻轻吹打令细胞重悬。4.分装:分装入无菌安剖中,每安剖加。5.封口:用塑料安剖时拧紧瓶口即可;如用火焰封闭安剖口后,仔细检查,定要封严,必要时可浸入蓝色液中观察,为安全起见,把安剖缝入纱布小袋中,以防液氮浸入后,融解时因受热发生伤人;纱袋一端系以线绳,末端扎有小牌,注明:细胞名称,冻存日期,以便日后查找。复苏方法1.从液氮罐中取出安剖;有时因安剖未封严,浸入了液氮,取出后因安剖内液氮迅速气化而发生,因此应带有防护眼睛和手套。2.迅速放入盛有36℃~37℃水的搪瓷罐中,扣上盖并不时摇动,尽快解冻。3.剪开纱布口袋,取出安剖,用70%酒精擦拭消毒后,净化台上打开盖,用吸管吸出细胞悬液,装入离心管中,再补加10ml培养液,吹打使细胞悬浮。4.低速离心(500~1000转/分)5分钟,取上清后再重复用培养液漂洗、离心。天津销售RNA合成仪价烙
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