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实时荧光定量常用Taqman探针法和SYBR Green I法两类。

1.TaqMan探针法

TaqMan 探针法是具有高度特异性的定量PCR技术。它的工作原理为有一对 PCR 引物和一条探针存在于PCR 反应体系中，有荧光淬灭基团存在于3′

端标记，有报告基团存在于探针的5′ 端标记，探针*和模板特异结合，两条引物之间是其结合点。因此信号仪器搜集不到，伴随反应的进展，探针在外切核酸酶的活性的作用下被切断，从而造成淬灭基团不能吸收基团的荧光能量，从而使荧光信号产生，所以模板 DNA 的拷贝数取决于信号的强度。

2.SYBR Green I法

SYBR Green I为一种具有绿色激发波长的染料，其发射波长比较大约为 520 nm，比较大吸收波长约为 497 nm，能够结合所有的双螺旋小沟区域。由于处于游离状态，SYBR Green I发出的荧光较弱，然而其结合双链 DNA之后，就会使得荧光**增强，荧光信号的增加完全同步PCR 产物的增加。 江苏基因突变荧光定量PCR实验技术服务

使用包含 3 种不同浓度的 ROX 染料的预混液对 TGF-β 进行扩增。显示 (A) Ct 值和 (B) 标准差随 ROX 染料浓度的变化。降低 ROX 染料浓度导致 Ct 出现得更早，但是会增大标准差。使用 Applied Biosystems 7500 实时荧光定量 PCR 系统执行所有扩增。

Ct 随 PCR 效率发生变化。蓝色标准曲线的效率为 **（斜率为 –3.3）。绿色标准曲线的效率为 78%（斜率为 –4）。与高效率条件相比（蓝色），在低效率条件下（绿色），扩增量 Y 使 Ct 出现得更早。较低扩增量 (X) 时则情况相反，与高效率条件（蓝色）相比，低效率条件（绿色）使 Ct 出现得更晚。

实时荧光定量 PCR 分析优化过程确实需要时间，但是所花的时间是值得的。这样得出的分析结果不仅具有比较高的灵敏度和比较大的动态范围，而且准确度高、效率高、重复性好，为实验提供可靠的数据。

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PCR 反应的效率也会影响 Ct 值。在低效率条件下进行连续稀释扩增，与高效率条件下相比，可能会产生斜率不同的标准曲线。在图 5 中，两个样品（X 和 Y）分别在低效率和高效率条件下扩增，在靶浓度相同的条件下得到了不同的 Ct 值。在此示例中，尽管高效率条件（图 5 中的蓝色曲线）在高浓度时产生的 Ct 值更晚，但它在靶浓度低时却更为灵敏。PCR 效率取决于实验、预混液性能和样品质量。通常情况下，反应效率在 90-110% 之间都是可以接受的。另一方面，假定所有其他因素如仪器、试剂和实验完全相同， 该效率也有助于得出***个样品的模板量更少的结论。然而，如果产生两个 Ct值使用的是不同的仪器、试剂、引物和探针或反应体积，该结论就不成立。因此，只有在使用上文定义的相同反应条件来比较实验时，Ct ***值的比较才有意义。江苏基因突变荧光定量PCR课题承包

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在实时荧光PCR中。模板的定量有2种方法：***定量和相对定量。***定量一般通过已知的标准曲线来确定我们所感兴趣基因的拷贝数；相对定量指在一定样品中靶序列相对于另一参照序列的量的变化

相对定量：相对定量法又分为两种

比较标准曲线的相对定量法：在一定样本中，靶序列相对于另一参照样本量变化情况进行分析的方法为相对定量法。在采用该方法过程中，需要有参照物，所以较容易绘制定量标准曲线，只要将标准品稀释度确定便可进行对比分析 天津非编码RNA 荧光定量PCR技术服务

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