以亚磷酰胺寡核苷酸合成为例介绍该类仪器的一般操作步骤。亚磷酰胺DNA合成的试剂有:保护碱基的5/—DMT,A、G、C、T亚磷酰胺单体,四唑偶联催化剂,乙酐,N—甲基咪唑封闭试剂,三氯乙酸(TCA)脱保护溶液,12氧化混合物,乙腈清洗溶剂,氨水切除溶液。使用步骤如下:1)仔细检查合成仪上所有试剂瓶中的试剂量,必要时换掉试剂瓶,特别注意乙腈的量,因为该溶剂用量较大。2)将标记好的清洁的收集瓶装在合成仪上。3)将要合成的DNA序列输入合成仪。4)检查选择的合成步骤是否正确。5)选择结束方法:TritylOffAuto是仪器的原始状态,若打算以5,—DMT基团连接纯化寡核苷酸,将其转变为TritylOnAuto结束状态。6)选择结束方法,一般为系统的原始状态。7)在每个柱监视器的Use下,江苏基因合成仪,输入你所希望的保存名字。8)以代码代替相应的DNA序列标记每一个收集瓶。9)打印出每一个柱设置的详细资料。10)检查打印出来的资料是否正确。11)运行StartColumn步骤检查每一个柱的位置,确保合成仪上合成柱处于正确的位置。12)检查连接在合成仪上的溶剂残留(废液瓶)是否充满。13)如果分部收集器用来收集每个DMT脱保护步骤的流出物,江苏基因合成仪,江苏基因合成仪,确保试管充分清洁干净,并打开分部收集器,确保DMT废液管路通向分部收集器。
二、按试剂碱基添加方式分类,DNA合成仪可分为电磁阀气动驱动,蠕动泵驱动两种类型。1,电磁阀气动驱动型:采用高于大气压的惰性气体(氩气,氮气或氦气)为碱基试剂溶液的驱动方式,通过微量电磁阀的开合添加试剂或碱基溶液。主要品牌包括ABI系列合成仪,oligomaker系列合成仪,biolytic系列合成仪,GE系列合成仪及mermade系列DNA合成仪等。2,采用蠕动泵驱动型:采用精密蠕动泵为碱基试剂溶液的驱动方式,通过蠕动泵驱动,滑块的相互滑动选择添加不同碱基试剂溶液。主要品牌包括德国POLYGEN系列DNA合成仪。三、按产物承载容器分,可分为需要一次性合成柱,无需一次性合成仪两类。除德国polygen系列合成仪外,其它所有品牌合成仪,如,oligomaker,mermade,ASM,POLYPLEX,ABI等都使用一次性合成柱作为合成产物的承载容器。
2, 工业型工业型合成仪,主要指合成通量大,且单柱合成产物为10-1000nmol的DNA合成仪。工业型合成仪常见的合成柱数为96柱、192柱,384柱或更多合成柱数的合成仪较为鲜见。主要适用于大型实验室,公用实验平台及商业合成机构。国内主要的商业合成机构如上海生工,北京赛百盛,上海捷瑞,华大基因,金斯特,金维斯等。该类型DNA合成仪较实验室型品牌相对较少,常见的品牌有美国biolytic,丹麦oligomaker,美国mermade,美国polyplex等。在欧洲,polygen 96柱合成工作站及384柱合成塔也是较常见的工业型合成仪之一。
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