**初是sanger法,后来发展了几种高通量测序方法1sanger法:双脱氧测序的原理,DNA合成时加上一个ddNTP从而终止这条链的延伸,毛细管电泳读取分析序列。一般教材讲的都是这种方法,经典,读长800bp,但是通量小成本高。2454:也称焦磷酸测序,一个run下来约400M的数据量。将emulsionPCR产物连磁珠上,放入PicoTiterPlate,测序反应是通过释放PPi经过ATP***化酶和荧光素酶作用发光D捕捉拍照,反应是连续的,所以遇到连续的碱基如polyA时,454易产生误差。3Solexa:边合成边测序,将DNA单链固定在芯片上,合成DNA簇,是一种可逆阻断的合成反应,每个循环只加上一个碱基、系统拍照一次。通过读取拍照信号分析序列,江苏本地RNA合成仪品牌企业,一个run约200个G数据量以上。目前能量比较高,不足是读长短,现在有PE150,可以测通300bp。4Soild:与454有相似之处,该方法更精细,磁珠富集,磁珠更小,密度更高。它的独特之处是连接反应测序,加入8碱基荧光单链混合物。一次测序读两个碱基,江苏本地RNA合成仪品牌企业,江苏本地RNA合成仪品牌企业,获得颜色编码组成的碱基序列,通过几轮反应**终得出序列。5Iontorrent:特点是小巧。试剂通过集成的流体通路进入芯片中,密布于芯片上的反应孔立即成为上百万个微反应体系。
手工测序以及自动测序均属于DNA序列测定,手工测序可分为maxam-gilbert化学降解法与sanger双脱氧链终止法,事实上,目前dna序列分析的主流是自动测序。373型、377型、310型、3700和3100型等多种型号DNA测序仪均已经被美国peabi公司生产出来了,在这几款DNA测序仪中,临床检测实验室使用**多的一种型号要属310型。发展历史70年代末,化学法和双脱氧手动测序,同位素标记法分别由WalterGilbert与FrederickSanger发明出来。80年代中期,应用双脱氧终止法原理,自动测序仪出现了,同位素被荧光取代了,计算机图象识别。90年代中期,测序仪得到了重大改进,凝胶电泳由集束化的毛细管电泳取代了。2001年,人类基因组框架图被完成。注意事项1.bigdye荧光标记终止底物循环测序试剂盒为本实验使用的测序试剂盒,通常650bp左右为可测dna长度,(±)%为本仪器dna测序精确度,如果仪器所需测定的长度高于650bp,不能辨读的碱基n<2%,那么就需要设计另外的引物。能够设计反向引物对同一模板进行测序,相互印证以便确保更为准确地测序。能够人工核对n碱基,有时能够将其辨读出来,为了使测序的精确度提高,按照星号提示位置,能够对该处彩色图谱进行人工分析,进一步核对该处碱基。
表面等离子共振技术,简称SPR,是从20世纪90年代发展起来的一种新技术,对在生物传感芯片(biosensorchip)上配位体与分析物之间的相互作用情况的检测是SPR应用原理。在各个领域得到***地应用。原料有如下几种亲和分子:1.凝集素–聚糖/糖蛋白(Lectin–Polysacharride/Glyctein)2.蛋白质–小分子tein–SmallMolecule)3.蛋白质–核酸tein–NucleicAcid)4.细胞–配体(Cell–Ligand)5.蛋白质–蛋白质(tein)6.多肽–受体(Peptide–Receptor)7.抗体–抗原(Antibody–Antigen)8.膜受体–配体(MembraneReceptor–Ligand)调和方法任何一对亲和分子,一个(分析物)在溶液中放置,另一个(靶分子)在生物传感器表面键合。如果在靶分子键合的生物传感器表面有含有分析物的溶液流经。就会生成亲和性复合物。双通道流动注射分析式微射流系统为SensiQ所配备,有85nL流动池在其内。一次性的SPR生物传感器为SensiQ所使用,能够简便地装卸。有单层的羧基化寡聚环氧乙烷(CarboxylatedOligoethyleneoxide)基质包被于生物传感器表面,能够对多种生物分子进行键合,并且对非特异性结合及变性进行有效地阻止。靶生物分子既能够在固相生物传感器表面键合,又能够在液相中存在。
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