早期许多集中于特定代谢途径的研究*能进一步说明代谢产物产量提高与其生物合成途径中关键酶的过表达之间本已存在的必然联系，如表面活性肽(Surfactin)与其合成酶基因srfA[36]，琥珀酸(Sinicacid)与葡萄糖代谢途径[25]，达托霉素(Daptomycin)与其关键合成酶非核糖体肽合成酶(NRPS)[38]等，上海 重组人源Claudin18.2蛋白规格齐全。与此同时，越来越多的研究也开始揭示其它遗传因素对生物合成途径的重要调控，例如基因组重排后普那霉素(Pristinamycin)产量的大幅提升不仅与其生物合成基因snaB、snbA和自我抗性基因ptr的过量表达有关，还受到了AfsR转录调控子和转座酶同源编码基因变异的影响[56]；而对纳他霉素(Natamycin)的基因组重排高产突变菌进行的遗传多态性研究发现，54种差异表达的蛋白中*有葡萄糖激酶调节蛋白直接参与了纳他霉素的生物合成[35]。因此，对微生物遗传和代谢网络的局部研究不能有效地甄别导致相关表型的遗传基础，更无法解析其中潜在的调控机制。步入后基因组时代，上海 重组人源Claudin18，上海 重组人源Claudin18.2蛋白规格齐全.2蛋白规格齐全，快速发展的各类组学和生物信息分析技术为我们***了解基因组重排介导的微生物定向进化提供了便利。转录组测序(RNA-Seq)初步揭示了基因组重排引起微生物表型变化的一些潜在遗传基础，如里氏木霉。
folds)[37]达托霉素DaptomycinUV+NTG玫瑰孢链霉菌Streptomycesroseosporus582mg/L(folds)[38]乳酸链球菌素NisinUV+DES乳酸乳球菌Lactocuslactis4023IU/mL(folds)[39]普那霉素PristinamycinUV始旋链霉菌Streptomycespristinaespiralis120mg/L(folds)[40]***肽芬荠素FengycinNTG+RE解淀粉芽孢杆菌Bacillusamyloliquefaciensmg/L(folds)[41]南强菌素DeacetylmycoepoxydieneUV拟茎点霉(folds)[42]谷胱甘肽GlutathioneUV+NTG酿酒酵aromycescerevisiaemg/L(folds)[43]聚γ-谷氨酸Poly-γ-glutamicacidUV+LiCl枯草芽孢杆菌Bacillussubtilisg/L(folds)[44]注：NTG：亚硝基胍；EB：溴化乙锭；DES：***二乙酯；EMS：甲磺酸乙酯；BU：溴尿嘧啶；MW：微波；RE：核糖体工程；ARTP：常压室温等离子体；UV：紫外线；NA：未知.Note:NTG:Nitrosoguanidine;EB:Ethidiumbromide;DES:Diethylsulfate;EMS:Ethylmethanesulfonate;BU:Bromouracil;MW:Microwave;RE:Ribosomeengineering;ARTP:Atmosphericandroom-temperatureplasma;UV:Ultraviolet;NA:Notavailable.表选项生物信息学研究表明，微生物作为活性天然产物的重要来源，其中蕴含着丰富的次级代谢产物生物合成基因簇。
更为精细地实施对微生物的人工调控和定向进化提供了契机。本文系统性地回顾了近年来基因组重排在微生物菌种选育中的应用研究，尤其针对围绕其开展的组学研究进行了详细阐述，并对基因组重排与组学、生物信息学和合成生物学等新兴技术的联合应用进行了展望。关键词：微生物代谢产物菌种选育基因组重排组学生物信息分析gressingenomeufflinhepostgenomiceraformicrobialstrainsivementJIANGCheng-Zhou1,HUANGYong1,2,3,DUANYan-Wen1,2,3,ZHUXiang-Cheng1,2,():March16,2018Foundationitem:gramofroducingTalentsofDisciploUniversities(111ject)(B0803420)*Correspondingauthor:ZHUXiang-Cheng,E-mail:seanzhu1996@.Abstract:Asapracticalandefficientstrainbreedingtechnology,genomeufflinghascircumventedtheessentialrequirementsofprehensivelycognizedgicbackgroundandoperablegicsystemforthemicrobialmanipulations,，比如乳酸、丙酸、乙醇和丙二醇等初级代谢产物是替代传统石油化工实现绿色制造和生物质能源开发的重要基础[1]；而结构和活性多样化的次级代谢产物则是新药开发的主要源泉[2]。作为发酵工业**的微生物菌种。
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