3、主要平台提供方ABI公司三、二代测序简介1、Roche454测序:454测序是大规模平行测序的开始。2003年底，454公司推出了基于焦磷酸测序法的超高通量基因组测序系统—(GS)。2005年454公司被罗氏诊断公司收购，之后优化推出GenomeSequencerFLXSystem(GSFLX)。罗森博格博士是该技术的创始人,也是IonTorrent平台的创始人。454平台的突出优势是长读长(400nt)，但准确率低，成本高。是高通量测序的过渡。454测序技术的具体步骤为：（1）构建测序文库。将基因组DNA打碎成300～800个碱基片段后，在两端加上锚定接头；（2）PCR扩增。扩增产生成千上万个拷贝；（3）焦磷酸测序。复制过程中如果发生碱基互补配对，就会释放1个焦磷酸，在一系列酶的催化下，天津多基因联合检测迈杰转化医学NGS平台技术指导，释放出荧光信号，会被CCD捕获到，天津多基因联合检测迈杰转化医学NGS平台技术指导。每个碱基反应都会捕获到1个荧光信号，天津多基因联合检测迈杰转化医学NGS平台技术指导，由此一一对应，模板的碱基序列由此获得。作者：心平气和链接：源：知乎著作权归作者所有。商业转载请联系作者获得授权，非商业转载请注明出处。 MSH6抗体试剂 苏苏械备20180569号.天津多基因联合检测迈杰转化医学NGS平台技术指导

    1、Illumina原理：桥式PCR+4色荧光可逆终止+激光扫描成像主要步骤：①DNA文库制备——超声打断加接头②Flowcell——吸附流动DN**段③桥式PCR扩增与变性——放大信号④测序——测序碱基转化为光学信号优势劣势：Illumina的这种测序技术每次只添加一个dNTP的特点能够很好的地解决同聚物长度的准确测量问题，它的主要测序错误来源是碱基的替换。而读长短（200bp-500bp）也让其应用有所局限。2、Roche454油包水PCR+4种dNTP车轮大战+检测焦磷酸水解发光主要步骤：①DNA文库制备——喷雾打断加接头②乳液PCR——注水入油**PCR③焦磷酸测序——磁珠入孔，焦磷酸信号转化为光学信号优势劣势：454技术优势测序读长较长，平均可达400bp，缺点是无法准确测量类似于PolyA的情况时，测序反应会一次加入多个T，可能导致结果不准确。也正是由于这一原因，454技术会在测序过程中引入插入和缺失的测序错误。3、IonTorrent原理油包水PCR+4种dNTP车轮大战+微电极PH检测主要步骤：①DNA文库制备——喷雾打断加接头②乳液PCR——注水入油**PCR③微电极pH检测——磁珠入池记录pH优势劣势：IonTorrent与454相比，主要差异在测序中，IonTorrent不需要昂贵的物理成像设备，成本相对较低体积较小。天津多基因联合检测迈杰转化医学NGS平台技术指导MLH1抗体试剂 苏苏械备20180519号.

    甲基化分析PacBio测序的技术原理可以直接检测到发生甲基化的核苷酸，因此可以在进行其它测序分析的同时完成DNA甲基化的分析。Nanopore技术测序原理将在某一面上含有一对电极的特殊脂质双分子层置于一个微孔之上，该双分子层中含有很多由α溶血素蛋白组成的纳米孔，并且每个纳米孔会结合一个核酸外切酶。当DNA模板进入孔道时，孔道中的核酸外切酶会“抓住”DNA分子，顺序剪切掉穿过纳米孔道的DNA碱基，每一个碱基通过纳米孔时都会产生一个阻断，根据阻断电流的变化就能检测出相应碱基的种类，**终得出DNA分子的序列。Nanopore技术的优缺点Nanopore技术的优点：可以检测结构变异和可变剪切；能直接对RNA分子进行测序；能对修饰过的碱基进行测序；测序读长更长，可以达到150kb；测序数据可以做到实时监控；运行速度快。Nanopore技术的缺点：采用的是水解测序法，不能进行重复测序，因而无法达到一个满意的测序精确度。Nanopore技术的应用基因组组装利用其测序长的特点，可以填补基因组中大片段的gap。临床应用对于临床实践，实时获取和分析DNA/RNA序列是一件很重要的事情，对于传统的高通量测序，做到这一点非常困难，但对于Nanopore技术平台，实现实时获取序列相对容易。

    二代测序是一个强大的功能平台，它可以同时给数以万计的DNA分子进行测序。由于这种可以多个样本同时测序的能力，在个性化医疗、遗传疾病和临床诊断等方面，二代测序也就是高通量测序开创了**性的领域。早在1900年代就发明的Sanger测序法，成为了DNA测序的黄金法则，即便到了***它仍被***用来进行常规测序和NGS数据的验证。它利用高保真DNA聚合酶生成与单链DNA模版互补的拷贝。在每个反应中，一个可以特异性识别模版的单链引物，可以从3端开始启动DNA合成，根据碱基互补配对原则，脱氧核糖核苷酸或简单的核苷酸是一个接一个的与模版配对。每个反应还包含四种双脱氧核糖核苷酸的混合物，每一种对应一个DNA碱基。这些双脱氧核糖核苷酸与DNA单体十分类似，因此可以参与DNA链的增长，但是他们和天然的脱氧核糖核苷酸有两点不同：（1）他们缺少一个会影响DNA链进一步衍生的3’羟基。在DNA延伸过程中，这个3’羟基一旦加入DNA分子中就会导致链的终止；（2）每个双脱氧核糖核苷酸都有独特的荧光染料吸附，使得DNA测序的自动检测得以进行。 迈杰转化医学可以提供覆盖肺ai、肠ai、肝ai、胃ai、乳腺ai、前列腺ai等多种实体瘤的上百项检测项目。

    本发明属于法医学技术领域，具体涉及基于二代测序技术检测68个基因座的试剂盒及其使用的引物组合，尤其涉及基于二代测序技术检测67个y-str基因座和amelogenin基因座的试剂盒及其使用的引物组合。背景技术：短串联重复(shorttandemrepeat，str)是由2～6bp重复单位串联组成且***存在于人类基因组中的一类具有长度多态性的dna序列，是目前法医个体识别和亲子鉴定应用*****的遗传标记。人类y染色体短串联重复(y-chromosomeshorttandemrepeats，y-str)具有父系遗传、缺乏重组、分型简单、信息量大、多态性高等特点，是研究人类的起源进化、民族差异、种族差异、群体及地区分布等的有力工具。因此，y染色体str基因座多态性研究可为法医学个体识别和亲权鉴定提供重要手段，在诸如父系家族的亲权鉴定、混合斑男性成分的检测、不同男性个体混合物的分析、追溯父系迁移历史及重构同一父系家族等方向都具有独特的应用价值。目前，荧光标记多重扩增结合毛细管电泳(fluorescentlabeledmultiplexpcr-capillaryelectrophoresis，pcr-ce)是str分型的主流技术；常用的商业化y-str分型试剂盒有y23(promega)、y(promega)、yfiler(thermofisherscientific)和yfilerplus。迈杰转化医学获得了欧盟ISO 13485质量认证并通过了国家医疗器械GMP稽查。上海Claudin18.2迈杰转化医学NGS平台口碑推荐

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panFGFxpanel的优势在于：针对性强——panel“小而精”，集中研究FGFR及上下游信号通路关键基因；应用性广——panel小，成本低；搭配酶切建库法、快速杂交法，缩短TAT；灵活性强——探针可实现物理上模块区分，随时满足伴随诊断产品开发需求。➤➤方案3：IHC法检测FGF-19过表达当前针对肝*及乳腺*的FGFR4抑制剂开发速度很快，多个药物进入临床II期的研究。FGFR4-FGF19信号通路在肝细胞*（HCC）的发***展过程中发挥重要的作用。有研究显示，在骨骼肌中过表达FGF19的转基因小鼠在其生命早期会发生多发性HCC，而其他组织则不会受到影响，初步推断FGF19通过***FGFR4增加肝细胞增殖而诱导肝*（图6）。

图6高表达FGF19-FGFR4靶向晚期肝*[10]FGFR4高选择性抑制剂在FGF-19过表达的HCC荷瘤小鼠病理模型上呈现了***的抗**药效。FGF-19扩增和过表达有望成为FGFR4选择性抑制剂***HCC的重要生物标志物。迈杰转化医学的病理平台已经建立并系统验证了FGF-19IHC检测方法，迄今已为国内众多创新药企的临床研究提供了检测支持服务（图7）。 天津多基因联合检测迈杰转化医学NGS平台技术指导

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