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吉林定制迈杰转化医学NGS平台来电咨询 值得信赖 迈杰转化医学供应

信息介绍 / Information introduction

    h1)str分型;(h2)y-str分型;(h3)个体识别;(h4)亲权鉴定;(h5)种族推断。本发明还保护上述任一所述引物组合或上述任一所述复合扩增体系的应用,可为(h1)-(h5)中的至少一种:(h1)str分型;(h2)y-str分型;(h3)个体识别;(h4)亲权鉴定;(h5)种族推断。上述任一所述68个基因座具体可由amelogenin、dys19、dys385a/b、dyf387s1a/b、dys388、dys389-i、dys389-ii、dys390、dys391、dys392、dys393,吉林定制迈杰转化医学NGS平台来电咨询、dyf399s1、dyf404s1a/b、dys437、dys438、dys439、dys443、dys444、dys446、dys447、dys448、dys449、dys456、dys458、dys459a/b、dys460、dys481、dys485、dys504、dys505、dys508、dys510、dys518、dys520、dys522、dys527a/b、dys531、dys533、dys549、dys552、dys557、dys570、dys576、dys587、dys593、dys596、dys612、dys617、dys622、dys626、dys627、dys630、dys635、dys641、dys643、dys644,吉林定制迈杰转化医学NGS平台来电咨询、dys645、dys710、dys720、y-gata-a10和y-gata-h4组成。其中,amelogenin为性别决定基因座。dyf399s1包含三个分型片段。dys385a/b、dyf387s1a/b、dyf404s1a/b、dys459a/b和dys527a/b均包含两个分型片段,吉林定制迈杰转化医学NGS平台来电咨询。本发明提供的试剂盒可以检测68个基因座。 迈杰转化医学利用数字PCR进行低丰度突变研究等;提供循环肿l瘤DNA检测,可检测EGFR、ERBB2等Biomarker。吉林定制迈杰转化医学NGS平台来电咨询

    本发明涉及生物技术领域,特别涉及二代测序文库构建技术。背景技术:二代测序由于其超高的测序能力在科研和临床中具有极为重要的应用。二代测序技术也称深度测序、大规模平行测序,**思想是边合成边测序(SequencingbySynthesis),即通过捕捉新合成的末端的标记来确定DNA的序列,现有的技术平台主要有Roche/454FLX、Illumina/SolexaGenomeAnalyzer和AppliedBiosystemsSOLIDsystem。这三个技术平台各有优点,454FLX的测序片段比较长,高质量的读长能达到400bp;Solexa测序性价比**高,不*机器的售价比其他两种低,而且运行成本也低,在数据量相同的情况下,成本只有454测序的1/10;SOLID测序的准确度高,原始碱基数据的准确度大于%,而在15×覆盖率时的准确度可以达到%。Illumina/SolexaGenomeAnalyzer测序的基本原理是边合成变测序。在Sanger等测序方法的基础上,通过技术创新,用不同颜色的荧光标记四种不同的dNTP,当DNA聚合酶合成互补链时,每添加一种dNTP就会释放出不同的荧光,根据捕捉的荧光信号并经过特定的计算机软件处理,从而获得待测DNA的序列信息。二代测序的一般流程如下:1)文库制备,将DNA用雾化或超声波随机片段化成几百碱基或更短的小片段。湖北全平台迈杰转化医学NGS平台技术指导经多平台平行验证(MSI-PCR、MSI-NGS),一致性高,特异性好.

  上述任一所述复合扩增体系还可包括进行pcr扩增反应所需的试剂。所述“进行pcr扩增反应所需的试剂”不包括pcr扩增反应所需的引物。上述任一所述复合扩增体系可为20μl,由10μl2×mastermix、上述任一所述引物组合和模板组成。2×mastermix具体可为德国qiagen公司的产品。所述模板具体可为浓度为1ng/μl的标准品2800m的水溶液或样品的基因组dna。所述样品可为人口腔拭子。所述标准品2800m具体可为promega公司的产品,产品目录号为dd7251。含有上述任一所述引物组合的试剂盒也属于本发明的保护范围;所述试剂盒的用途可为(h1)-(h5)中的至少一种:(h1)str分型;(h2)y-str分型;(h3)个体识别;(h4)亲权鉴定;(h5)种族推断。本发明还保护上述任一所述复合扩增体系或上述任一所述试剂盒的制备方法;该制备方法包括将上述任一所述引物组合中的各条引物单独包装的步骤。本发明还保护上述任一所述引物组合或上述任一所述复合扩增体系在制备试剂盒中的应用;所述试剂盒的用途可为(h1)-(h5)中的至少一种:。

    套峰细分的话有如下几种情形:全双峰:如样品为克隆后质粒,则质粒中含有多个引物结合位点;如样品为PCR产物,则含有非特异性扩增。前端双峰:如样品为克隆后质粒,则其含有多个引物结合位点,并且其中一套模板出现测序中断的现象;如样品为PCR产物,则PCR产物中含有多个引物结合位点,或者PCR产物中含有引物二聚体等小片段污染。中间双峰:如样品为克隆后质粒,则质粒并非单克隆;如样品为PCR产物,则部分产物中具有碱基缺失现象,或目的基因为等位基因导致PCR产物自身不纯。后端双峰:如样品为克隆后质粒,则质粒并非单克隆;如样品为PCR产物,则部分产物中具有碱基缺失现象。解决办法:针对二聚体及小片段干扰的情况,可以使用切胶回收的方法纯化PCR产物;针对含有多个引物结合位点的情况,应当更换测序引物;针对PCR产物出现碱基缺失的情况,可以使用克隆后测序以排除碱基缺失的产物;针对非单克隆的情况,应在确认克隆无误的前提下重新挑取单克隆进行测序;针对PCR产物含有非特异性扩增的情况,应优化PCR反应条件去除非特异性扩增,重新制备样品测序;针对等位基因具有双模板的情况,应当采用克隆测序以保证单次测序样品序列一致。 迈杰转化医学致力于解决创新药物的研发痛点及患者的用药痛点,助力精z准医疗!

    迈杰转化医学NGS平台现有IlluminaNovaSeq6000、NextSeq500、Miniseq测序仪及QiagenGenereader等一站式临床诊断测序平台,目前已建立的常规检测能力包括WGS、WES、mRNA-Seq,lncRNA-Seq,miRNA-Seq,靶向富集测序,单细胞基因组/转录组测序,免疫组库测序、慢病毒插入位点检测等。平台多次满分通过国家卫生部临检中心(NCCL)及美国病理学家协会(CAP)组织的室间质评与能力认证;已完成20+方法学开发与验证,支持40多个临床实验,完成了数千例余例样本的检测。6、全外显子组测序一种生物的外显子序列的测序,外显子测序需要将全基因组外显子区域DNA捕获并富集后进行测序;人的外显子序列只占全部基因序列的1%,约30MB,是基因组的编码序列;相对于基因组测序分析的信息量小,成本较低。7、转录组测序细胞内转录产物RNA的测序,广义上包括mRNA、核糖体RNA、转运RNA及非编码RNA;狭义指所有mRNA的**。8、靶向测序作者:心平气和链接:源:知乎著作权归作者所有。商业转载请联系作者获得授权,非商业转载请注明出处。 迈杰转化医学与全球品牌药企广f泛展开伴随诊断产品的开发合作,已有多个诊断产品上市。湖北全平台迈杰转化医学NGS平台技术指导

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    既节约时间又降低测序成本。目前,基于法庭科学领域运用**多的ngs系统为illumina公司的miseqfgxtm系统和thermofisher公司的iontorrentpgmtm系统,但针对以上平台的二代测序商业化str分型试剂盒的研发尚处于起步阶段,主要有powerseqautosystem(promega,madison,wi,usa)、forenseqtmdnasignatureprepkit(illumina,sandiego,ca,usa)和precisionidglobalfilerngsstrkit(termofisher,waltham,ma,usa)。但以上试剂盒涉及的y-str相对较少,三个试剂盒分别包含了1个y-str基因座、26个y-str基因座、2个y-str基因座。同时存在试剂盒价格昂贵,配套的数据分析软件只能针对各自开发试剂盒,参数的设置相对固定,只能对固有基因座的测序数据进行分析,不利于法医学实际应用。因此,构建一种适用于当前主流二代测序检测平台miseqfgxtm系统及开放性测序数据分析软件straitrazor、myflq等,且能容纳更多y-str基因座的复合扩增体系具有一定的意义。技术实现要素:本发明的目的是制备检测更多y-str基因座的试剂盒,提高了父系亲缘关系分析能力和鉴定效能。本发明首先保护引物组合,可包括引物1—引物120;引物1—引物120均为单链dna分子,核苷酸序列依次可如seqid**—seqid**20所示。吉林定制迈杰转化医学NGS平台来电咨询

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