一、测序策略：DNA样本检测：检测DNA样本的完整性、浓度和纯度等；文库构建：DNA样本检测合格后，将基因组DNA随机打断成300-500bp大小，DNA末端连接接头，纯化连接产物，PCR扩增，完成文库构建，河北专注迈杰转化医学NGS平台郑重承诺，文库构建后进行质检；上机测序：文库质检合格后，上机测序，河北专注迈杰转化医学NGS平台郑重承诺。二、样本要求：请老师自行提取DNA或cDNA，干冰送样。DNA样本要求：DNA浓度≥50ng/ul，总量≥3ug；OD260/280在，无RNA、蛋白质等杂质污染，无降解。三、分析内容：原始测序数据说明原始测序数据质控原始测序数据质量剪切及统计物种注释及丰度分析物种注释基本步骤物种丰度分析物种多样性分析物种***性差异分析四、报告模板：查看完整的宏病毒组结题报告模板请点击：Seqmore_宏病毒测序分析结题报告，河北专注迈杰转化医学NGS平台郑重承诺.pdf。迈杰转化医学基于基因组学、蛋白质组学、细胞组学及病理学等综合性转化医学全平台。河北专注迈杰转化医学NGS平台郑重承诺

    染色体STR不属于测序技术的，它是一类分子检测技术，例如Y染色体-STR，一般通过PCR、电泳凝胶结合来分析这段串联重复序列的存在或者多态性，常用来检测性别或亲子鉴定，而不能测出具体的DNA序列信息。测序技术是一代测序（sanger测序）、二代测序（高通量测序）、三代测序（单分子测序）为基础的。二代测序的缺点主要是由其PCR边复制边读取的原理决定的，测序时间长，读长短，末端质量差。三代测序中PacBio实际上就是针对这些缺点的升级，通过巧妙的微孔设计实现单分子读取，而且可以屏蔽游离dNTP的信号，不用每读取一次就要清洗—添加一次dNTP，所以读长比较长，测序速度快。 四川一体化迈杰转化医学NGS平台服务至上迈杰转化医学拥有3D HISTECH Pannoramic MIDI数字化病理扫描仪及91360远程病理系统。

    01FGFR简介及信号通路成纤维细胞生长因子受体(FGFR)是高度保守、***分布的跨膜酪氨酸激酶受体，包括FGFR1、FGFR2、FGFR3、FGFR4四种受体亚型。成纤维细胞生长因子（FGF）与FGFR结合时，受体二聚化，从而引起受体激酶结构域的细胞内磷酸化、细胞内信号传导和基因转录的级联反应[1]。由FGFR***的信号转导通路包括RAS–RAF–MAPK，PI3K–AKT，STAT和PLC途径，它们参与调控多种生物学过程，如***发育、血管新生、细胞增殖、迁移、抗凋亡等（图1）。图1FGFR信号通路[2-4]当FGFR发生突变或者过表达时，会引起四个关键的下游信号通路的过度***，并进一步诱发正常细胞*变：RAS-RAF-MAPK和PI3K-AKT过度***可分别刺激细胞增殖与分化及抑制细胞凋亡；SATA与促进**侵袭和转移，****逃逸能力密切相关；PLCγ信号通路则是**细胞转移调控的重要途径。

    h1)str分型；(h2)y-str分型；(h3)个体识别；(h4)亲权鉴定；(h5)种族推断。本发明还保护上述任一所述引物组合或上述任一所述复合扩增体系的应用，可为(h1)-(h5)中的至少一种：(h1)str分型；(h2)y-str分型；(h3)个体识别；(h4)亲权鉴定；(h5)种族推断。上述任一所述68个基因座具体可由amelogenin、dys19、dys385a/b、dyf387s1a/b、dys388、dys389-i、dys389-ii、dys390、dys391、dys392、dys393、dyf399s1、dyf404s1a/b、dys437、dys438、dys439、dys443、dys444、dys446、dys447、dys448、dys449、dys456、dys458、dys459a/b、dys460、dys481、dys485、dys504、dys505、dys508、dys510、dys518、dys520、dys522、dys527a/b、dys531、dys533、dys549、dys552、dys557、dys570、dys576、dys587、dys593、dys596、dys612、dys617、dys622、dys626、dys627、dys630、dys635、dys641、dys643、dys644、dys645、dys710、dys720、y-gata-a10和y-gata-h4组成。其中，amelogenin为性别决定基因座。dyf399s1包含三个分型片段。dys385a/b、dyf387s1a/b、dyf404s1a/b、dys459a/b和dys527a/b均包含两个分型片段。本发明提供的试剂盒可以检测68个基因座。迈杰转化医学具体包括全套的Leica组织样本制备系统，Ventana、Leica、DAKO等全自动免疫组化仪。

    本发明属于法医学技术领域，具体涉及基于二代测序技术检测68个基因座的试剂盒及其使用的引物组合，尤其涉及基于二代测序技术检测67个y-str基因座和amelogenin基因座的试剂盒及其使用的引物组合。背景技术：短串联重复(shorttandemrepeat，str)是由2～6bp重复单位串联组成且***存在于人类基因组中的一类具有长度多态性的dna序列，是目前法医个体识别和亲子鉴定应用*****的遗传标记。人类y染色体短串联重复(y-chromosomeshorttandemrepeats，y-str)具有父系遗传、缺乏重组、分型简单、信息量大、多态性高等特点，是研究人类的起源进化、民族差异、种族差异、群体及地区分布等的有力工具。因此，y染色体str基因座多态性研究可为法医学个体识别和亲权鉴定提供重要手段，在诸如父系家族的亲权鉴定、混合斑男性成分的检测、不同男性个体混合物的分析、追溯父系迁移历史及重构同一父系家族等方向都具有独特的应用价值。目前，荧光标记多重扩增结合毛细管电泳(fluorescentlabeledmultiplexpcr-capillaryelectrophoresis，pcr-ce)是str分型的主流技术；常用的商业化y-str分型试剂盒有y23(promega)、y(promega)、yfiler(thermofisherscientific)和yfilerplus。 迈杰基于基因组学、蛋白组学、细胞组学及病理组学等综合性转化医学平台，丰富的伴随诊断开发经验。四川一体化迈杰转化医学NGS平台服务至上

迈杰中心实验室设有SLAN 96P、Rotor-Gene Q、ABI 7500、ABI ViiA7、Roche z480等实时荧光定量PCR仪及数字PCR仪！河北专注迈杰转化医学NGS平台郑重承诺

    第三代测序技术以PacBio公司的SMRT技术和OxfordNanoporeTechnologies公司的纳米孔单分子技术为**的新一代测序技术被称为第三代测序技术，与前两代测序技术相比，其比较大的特点就是单分子测序，测序过程无需进行PCR扩增，并且理论上可以测定无限长度的核酸序列。PacBio技术平台SMRT芯片是一种带有很多ZMW孔的厚度为100nm的金属片，将DNA聚合酶、待测序列和不同荧光标记的dNTP放入ZMW孔的底部。荧光标记的位置是磷酸基团，当一个dNTP被添加到合成链上的同时，它会进入ZMW孔的荧光信号检测区，根据荧光的种类就可以判定dNTP的种类，从而获得核酸的碱基序列信息。ZMW孔PacBio平台测序原理每个ZWM孔只允许一条DNA模板进入，DNA模板进入后，DNA聚合酶与模板结合，加入4种不同颜色荧光标记4种dNTP，其通过布朗运动随机进入检测区域并与聚合酶结合从而延伸模板，与模板匹配的碱基生成化学键的时间远远长于其他碱基停留的时间，因此统计荧光信号存在时间的长短，可区分匹配的碱基与游离碱基。通过统计4种荧光信号与时间的关系，即可测定DNA模板序列。 河北专注迈杰转化医学NGS平台郑重承诺

免责声明： 本页面所展现的信息及其他相关推荐信息，均来源于其对应的用户，本网对此不承担任何保证责任。如涉及作品内容、 版权和其他问题，请及时与本网联系，我们将核实后进行删除，本网站对此声明具有最终解释权。