用聚合酶和外切核酸酶把DN**段切成平末端，紧接着磷酸化并增加一个核苷酸黏性末端。然后将测序接头与片段连接；2)簇的创建，将模板分子加入芯片用于产生克隆簇和测序循环。芯片有8个纵向泳道的硅基片。每个泳道内芯片表面有无数的被固定的单链接头。上述步骤得到的带接头的DN**段变性成单链后与测序通道上的接头引物结合形成桥状结构，以供后续的预扩增使用。通过不断循环获得上百万条成簇分布的双链待测片段；3)测序，辽宁专注迈杰转化医学NGS平台来电咨询，DNA聚合酶结合荧光可逆终止子，荧光标记簇成像，在下一个循环开始前将结合的核苷酸剪切并分解；4)数据分析，测序得到的原始数据是长度为几十个碱基的序列，要通过生物信息学工具将这些短的序列组装成长的Contigs甚至是整个基因组的框架，或者把这些序列比对到已有的基因组或者相近物种基因组序列上，进一步分析得到有生物学意义的结果。聚合酶链反应(即PCR)是一种***运用于分子遗传和诊断的技术，辽宁专注迈杰转化医学NGS平台来电咨询，用于放大扩增特定的DN**段，辽宁专注迈杰转化医学NGS平台来电咨询，可看作是生物体外的特殊DNA复制，可分析任何短的DNA序列，PCR的**大特点，是能将微量的DNA大幅增加，即使样品中只含有低水平的DNA。PCR技术可用于扩增分析用的DNA或RNA选定片段。MLH1抗体试剂 苏苏械备20180519号.辽宁专注迈杰转化医学NGS平台来电咨询

    thermofisherscientific)等。研究发现，基于pcr-ce分型时，相同片段长度的等位基因中存在重复区域序列结构不一致的情况。二代测序技术(secondgenerationsequencing，sgs)又称为下一代测序技术(nextgenerationsequencing，ngs)，具有测序通量高、速度快的优点。ngs不仅能从长度多态性上对str基因座进行分析，还能从序列上发掘str基因座的遗传多态性。随着ngs测序成本越来越低、测序读长逐渐的增加，ngs对str分型技术也越来越成熟。近年来，ngs技术已经应用于法医学str分型研究。相比于pcr-ce分型，ngs技术在y-str基因座的分析中具有很多优势：1、样本输入量低，使得微量样本及降解样本检材的分型研究变为可能；2、准确性高，能够全部覆盖基因座的每个碱基并通过产出高测序深度保证y-str基因座各等位基因的高概率精确判断的严谨性；3、能够获得y-str等位基因间的核苷酸差异信息，由于**重复结构存在差异或扩增区段内存在变异(侧翼序列的碱基突变或插入缺失)，序列长度相等的等位基因可能是具有遗传稳定性的完全不同的等位基因，这种y-str序列多态性是个体识别分析的宝贵资源；4、成本低，通过对每个样本检材添加标签一次可以同时对多个样本进行平行测序。 辽宁专注迈杰转化医学NGS平台来电咨询迈杰转化医学拥有3D HISTECH Pannoramic MIDI数字化病理扫描仪及91360远程病理系统。

    ⑦侧翼序列碱基数，各部分之间用tab键隔开。按照这种格式依次对68个基因座进行录入。68个基因座基因配置文件录入完成后，运行***。该文件给出了①基因座名称，②基因分型，③扩增子碱基数，④扩增子序列信息，⑤测序深度五个部分。根据国际法医遗传学会(internationalsocietyforforensicgenetics，isfg)发表的关于y-str基因座的str序列指南()和niststr数据库(strbase.)y染色体str情况说明对67个y-str基因座的序列构建**重复结构。实验结果见表3。结果表明，标准品2800m得到了完整的str分型，完全能够满足法医str检验的要求。表3-1注：n与其后数字表示一段碱基序列，其后数字表示序列的碱基数目。表3-2注：n与其后数字表示一段碱基序列，其后数字表示序列的碱基数目。二、采用实施例1制备的试剂盒的应用——口腔拭子样本的基因座分型样本一、样本二和样本三为3名汉族男性无关个体的口腔拭子的基因组dna，浓度均为1ng/μl。3名汉族男性均知情同意。将步骤一中的标准品2800m水溶液替换为样本一、样本二或样本三，其它步骤均不变。检测结果见表3。结果表明，样本一、样本二和样本三均获得了完整的str分型结果。

    第三代测序技术以PacBio公司的SMRT技术和OxfordNanoporeTechnologies公司的纳米孔单分子技术为**的新一代测序技术被称为第三代测序技术，与前两代测序技术相比，其比较大的特点就是单分子测序，测序过程无需进行PCR扩增，并且理论上可以测定无限长度的核酸序列。PacBio技术平台SMRT芯片是一种带有很多ZMW孔的厚度为100nm的金属片，将DNA聚合酶、待测序列和不同荧光标记的dNTP放入ZMW孔的底部。荧光标记的位置是磷酸基团，当一个dNTP被添加到合成链上的同时，它会进入ZMW孔的荧光信号检测区，根据荧光的种类就可以判定dNTP的种类，从而获得核酸的碱基序列信息。ZMW孔PacBio平台测序原理每个ZWM孔只允许一条DNA模板进入，DNA模板进入后，DNA聚合酶与模板结合，加入4种不同颜色荧光标记4种dNTP，其通过布朗运动随机进入检测区域并与聚合酶结合从而延伸模板，与模板匹配的碱基生成化学键的时间远远长于其他碱基停留的时间，因此统计荧光信号存在时间的长短，可区分匹配的碱基与游离碱基。通过统计4种荧光信号与时间的关系，即可测定DNA模板序列。 迈杰转化医学基于基因组学、蛋白质组学、细胞组学及病理学等综合性转化医学全平台。

    降低引物的扩增效率，也需要重新设计并合成引物。3、初次复合扩增时，各个引物在反应体系中的浓度均为μm；之后对引物浓度进行调整，获得进行pcr扩增时各个引物的**佳浓度。经过上述步骤，获得引物组合。引物组合由120条引物组成，用于检测68个基因座。各个基因座的名称、扩增基因座对应的引物名称和引物的核苷酸序列依次见表1中第1列、第2列和第3列。进行pcr扩增时各个引物的**佳浓度见表1中第5列。表1各个基因座对应的引物在hg38人类参考基因组(hg38人类基因组的信息见网址./goldenpath/hg38/bigzips/)中的pcr扩增产物的长度和核苷酸序列详见表2。各个str基因座的pcr扩增产物的长度范围分布见图1。表2三、基于二代测序技术检测68个基因座的试剂盒的制备基于二代测序技术检测68个基因座的试剂盒包括引物混合物；引物混合物由步骤二制备的120条引物混合而成。实施例2、实施例1制备的试剂盒检测标准品2800m的str分型及其应用一、实施例1制备的试剂盒检测标准品2800m的str分型1、dna样本准备取标准品2800m，用超纯水稀释，获得浓度为1ng/μl的标准品2800m水溶液。2、pcr扩增以标准品2800m水溶液为模板，采用实施例1步骤三制备的引物混合物进行pcr扩增，得到pcr扩增产物。 迈杰转化医学拥有专业的病理医生提供相应的阅片或远程病理阅片服务。上海多基因联合检测迈杰转化医学NGS平台推荐咨询

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