PacBio技术的优缺点PacBio技术的优点：无需PCR扩增，不会人为的引入突变；超长读长，平均读长可达到10Kb，**长读长可以达到40Kb；覆盖均匀，无GC偏好性；通过reads的自我矫正，10X以上准确率能够达到；可以直接检测到甲基化信息，同步进行表观遗传学识别。PacBio技术的缺点：单条序列错误率较高，平均核苷酸准确性不到85%；测序成本较贵，河北一体化迈杰转化医学NGS平台口碑推荐。PacBio技术的应用基因组组装利用PacBio测序平台，可以克服部分序列GC含量高或重复序列多等问题，更好的进行基因组详细描绘，从而进行精细的基因注释等研究。PacBio测序平台不需要进行PCR扩增，因此可以减少基因组组装过程中的人为错误和偏差。PacBio测序平台读长较长，因此相比二代测序拼接结果更为准确，同时可以利用其长片段来填补二代数据组装中产生的gap和连接contig为scaffold。全长转录组测序利用PacBio测序平台读长较长的特点，进行转录组测序可以直接得到转录本的全长序列，河北一体化迈杰转化医学NGS平台口碑推荐，河北一体化迈杰转化医学NGS平台口碑推荐，省去了二代测序的拼接过程，使得过程更为简便，结果更为准确。 迈杰与大学，研究院所，医院的科研人员进行科研转化研究合作,包括基础科学研究及临床应用研究等。河北一体化迈杰转化医学NGS平台口碑推荐

    三代测序简介1、HelicoBioScience2008年4月，HelicoBioScience报道了单分子测序技术，读取单分子荧光的能力，是***家商业化单分子测序技术的公司，但仪器过于较贵，数据质量较差，于2010年停止运营。2、PacificBiosciences单分子实时技术（singlemoleculerealtime,SMRT）利用单分子技术和DNA聚合酶，在聚合反应的同时就可以读取测序产物，在测序速度、读长和成本方面有着巨大的优势和潜力，但目前读取速度偏低。以对单分子DNA进行非PCR测序为主要特征（二代测序平台基于PCR扩增的信号放大过程），长读长，实时，单分子等，但三代测序基于单分子酶学或者单分子电学，信号容易丢失，通量不高，单碱基的测序成本也居高不下。目前主要有RSII和sequel两款测序仪。3、纳米孔测序OxfordNanopore：纳米孔测序的原理可以简单地描述为：单个碱基通过纳米尺度的通道时，会引起通道电学性质的变化。理论上，A、C、G、T四种不同的碱基由于化学性质的差异，它们穿越纳米孔时引起的电学参数变化量也有差异，检测这些变化量，即可得到相应碱基的类型。 福建专业迈杰转化医学NGS平台郑重承诺迈杰转化医学--伴随诊断整体解决方案提供者,检测技术平台全涵盖.

    二、一代测序简介1、发生和发展***代测序技术是Sanger于20世纪70年代中末期发明的双脱氧链终止测序法，手动测序，用同位素标记，Sanger也因此获得其第2个诺贝尔奖（在Sanger发明双脱氧链终止测序法前WalterGilbert发明化学降解法测定DNA序列）；80年代出现***台自动化测序设备，荧光标记代替同位素，计算机图像识别；90年代中期测序仪重大改进，毛细管电泳替代凝胶电泳；2003年完成人类基因组测序工作。2、基本原理以单条DNA链为模板合成互补链，在DNA复制过程中，合成原料（2’脱氧核苷酸dNTP）中掺入标记过的2’3’ddNTP（双脱氧链终止测序法由此而来），就会产生一系列末端终止的DNA链，并能通过电泳按长度分辨。不同末端终止DNA链的长度是由掺入到新合成链上随机位置的ddNTP决定的。经PCR扩增反应，可以得到一系列长度不同的产物，由于ddNTP带有荧光标记，对产物进行电泳分离，并用相应的仪器进行检测，就可以读出模板的序列。链终止法反应的**仍是PCR法。作者：心平气和链接：源：知乎著作权归作者所有。商业转载请联系作者获得授权，非商业转载请注明出处。

    ***代测序技术常见问题及解决方法样品测序无信号此时测序完全失败，**可能的原因是待测样品出现了降解或引物失效，从而导致测序引物与待测样品无法结合。此时探索造成测序失败的具体原因并无实际意义，**快速、简便的办法是重新提供质量合格的引物和样品再次进行测序。样品测序信号差此种情况可能是引物或模板的质量不高或是引物和模板的匹配性不好引起的，但**有可能的原因是待测样品浓度偏低。待测样品浓度偏低可能是由于PCR效率较低，也可能是PCR与测序间隔时间过长，导致PCR产物降解。建议PCR完成后尽快进行测序，如果PCR产物浓度本身较低，可以使用PCR产物作为模板进行二次PCR，也可以对PCR产物进行克隆后，再进行测序。样品测序衰减可能是由于待测样品包含特殊的核酸结构，如重复序列、回文结构、发卡结构、GC富集区、AT富集区等。由于是样品本身结构问题，因此，无法通过优化测序反应解决，应从待测样品另一端进行反向测序，之后两端的测序结果拼接得到完整序列。样品测序中断此种情况是由于待测样品包含特殊高级结构，导致碱基无法与模板结合，DNA聚合酶无法继续延伸。此情况与样品测序衰减解决办法相同，均为从待测样品另一端进行反向测序。 迈杰转化医学获得了欧盟ISO 13485质量认证并通过了国家医疗器械GMP稽查。

    2005年，罗氏推出了***款二代测序仪罗氏454，生命科学开始进入高通量测序时代。后续随着Illumina系列测序平台的推出，极大降低了二代测序的价格，推动了高通量测序在生命科学各个研究领域的普及。目前，高通量测序已经成为一种常规研究方法，大量科研工作中均会用到。然而，为什么二代测序能实现高通量？为什么二代测序读长如此之短？为什么reads末端测序质量会降低？应该如何选择测序读长与打断片段的长度？想要回答这些问题，都需要详细了解二代测序的基本原理。本篇文章以典型的Illumina双末端测序为例，详细解析二代测序的原理。第二代测序（Next-generationsequencing，NGS）又称为高通量测序（High-throughputsequencing），是基于PCR和基因芯片发展而来的DNA测序技术。我们都知道一代测序为合成终止测序，而二代测序开创性的引入了可逆终止末端，从而实现边合成边测序（SequencingbySynthesis）。二代测序在DNA复制过程中通过捕捉新添加的碱基所携带的特殊标记（一般为荧光分子标记）来确定DNA的序列，现有的技术平台主要包括Roche的454FLX、Illumina的Miseq/Hiseq等。由于在二代测序中，单个DNA分子必须扩增成由相同DNA组成的基因簇，然后进行同步复制。 迈杰拥有StarLIMS实验室信息化管理系统，中心实验室获得了中国CNAS ISO 17025实验室认可、美国CAP认证。黑龙江多靶点迈杰转化医学NGS平台值得推荐

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    PacBio平台技术关键DNA聚合酶，该技术得到的序列读长主要跟DNA聚合酶的活性有关，它主要受激光对其造成的损伤所影响。荧光基团标记在核苷酸3'端磷酸上，在DNA合成过程中，3'端的磷酸键随着DNA链的延伸被断开，标记物被弃去，减少了DNA合成的空间位阻，维持DNA链连续合成，延长了测序读长。ZMW(零模波导孔)，将反应信号与周围游离碱基的强大荧光背景进行区分，在一个反应管中有许多这样的圆形纳米小孔，其外径*有100nm，激光从底部打出后不能穿透小孔进入上方溶液区，能量被限制在一个小范围里，使得荧光信号*来自这个小反应区域，孔外其它游离核苷酸单体依然留在黑暗中，从而实现将背景荧光降到比较低。PacBio平台技术优势1.近乎完美的一致性和准确性三代测序单碱基错误率虽然很高，但是这种单碱基的错误是随机发生的，因此，对同一段序列测序覆盖多次就能够进行纠错，一般覆盖到10X以上的深度就能达到。2.不存在测序的偏好性因为SMRT技术在样本制备时无需PCR扩增，对于某些具有极端的碱基组成的核酸区域，三代测序也是无偏好性的，同时也不受回文序列的影响。3.序列准确比对二代测序得到的序列由于长度不够，在进行比对时，会出现很多错误匹配，从而造成假阳性SNP位点。 河北一体化迈杰转化医学NGS平台口碑推荐

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