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水华现象作为水体富营养化的重要表征，甚至能导致水生态系统结构（成分、食物链、食物网）的崩溃和供水、养殖等功能的彻底丧失。水体富营养化过程中**重要的环节为藻类组成结构和数量变化，即藻类优势种类演变为适合在富营养水体中生长和竞争的种类，藻类丰度和生物量明显增加。作为食物链上的重要一环，藻类结构和数量对水环境和藻类的消费者均可能产生重要影响。传统的水质监测相比，淡水藻类监测结果能够综合准确地反映水环境质量状况和淡水生态系统本身的健康水平。
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